Abaixo uma explicação básica de como enviar pastas e arquivos de um servidor para via SSH.
#scp -r diretorio_local usuario@host:/diretorio_remoto
exemplo detalhado:
maquina 1 : 10.1.1.2
maquina 2 : 10.1.2.2
imagine que queira copiar o subdiretorio /home da maquina 1 para o diretorio /m2/home a maquina 2
scp -r /home/* [email protected]:/m2/home